1986 übernahm Werner Voigt das Traineramt bei Hansa Rostock, der in der Vorsaison unter Claus Kreul in die DDR-Liga abgestiegen war. Bei Hansa erreichte Voigt in seinem ersten Jahr nicht nur den sofortigen Wiederaufstieg, sondern auch den Einzug ins FDGB-Pokalfinale, welches trotz zwischenzeitlicher Führung mit 4:1 gegen den 1. FC Lokomotive Leipzig verloren ging. In der DDR-Oberliga 1987/88 erreichte Hansa unter Voigt mit einem neunten Rang den Klassenerhalt und qualifizierte sich 1988/89 mit einem vierten Rang für den internationalen UEFA-Pokal 1989/90. Dort schied Hansa schon in der ersten Runde gegen Baník Ostrava aus und belegte in der Saison 1989/90 den sechsten Tabellenplatz. Voigt wurde anschließend durch den westdeutschen Trainer Uwe Reinders ersetzt, der anschließend die letzte DDR-Meisterschaft und den Pokal gewann.
Werner „Pico“ Voigt starb am 22. April 2023 im Alter von 75 Jahren.